Ciencia España , Salamanca, Martes, 29 de septiembre de 2015 a las 11:13

Identifican y describen proteínas hasta ahora desconocidas

Científicos del Centro de Investigación del Cáncer de Salamanca presentan en Canadá los resultados de su participación en el Proyecto Proteoma Humano

JPA/DICYT Científicos del Centro de Investigación del Cáncer (centro mixto de la Universidad de Salamanca y el CSIC) han identificado y y descrito proteínas hasta ahora desconocidas y están presentado este trabajo en el congreso mundial anual de la Human Proteome Organization (HUPO 2015), que este año se celebra en Vancouver (Canadá) desde el pasado 27 de septiembre y hasta mañana, día 30.

 

EL CIC es uno de los centros de referencia en el Proyecto Proteoma Humano (Human Proteome Project) y en esta reunión aporta tres artículos publicados en la revista de más impacto en el área de proteómica, Journal of Proteome Research. Según la información del CIC recogida por DiCYT, entre ellos destaca un trabajo liderado y coordinado desde Salamanca que ha permitido identificar más de 9.000 proteínas simultáneamente en un único ensayo, de una línea celular de linfoma de célula B con una extraordinaria correlación con datos transcriptómicos; describiendo por primera vez varias de esas proteínas que permanecían desconocidas, convirtiéndose en referencia internacional. Estos resultados serán presentados por el investigador del CIC Manuel Fuentes en una conferencia plenaria.

 

En septiembre 2010, durante la conferencia anual de la Organización Mundial del Proteoma Humano, en Sydney (Australia), la comunidad proteómica internacional lanzó el Proyecto del Proteoma Humano (HPP). Este reto es un ambicioso proyecto para la caracterización de la expresión, abundancia y localización de al menos una isoforma representativa de cada uno de los 20.300 genes codificantes de proteínas descritos en el Proyecto Genoma Humano.

 

Utilidad para la lucha contra enfermedades

 

Uno de los objetivos principales del Human Proteome Project es la caracterización de todas las proteínas humanas en un contexto biológico, junto con el desarrollo de novedosas herramientas y reactivos. La comunidad científica, la comunidad clínica, así como la industria biotecnológica y la farmacéutica podrán utilizar posteriormente estos trabajos en el descubrimiento de biomarcadores útiles en el diagnóstico y pronóstico de enfermedades y la localización de dianas terapéuticas.

 

 

El Proyecto Proteoma Humano ha sido concebido como un esfuerzo coordinado. Mediante las iniciativas centradas en cromosomas y enfermedades, se garantiza la finalización de este proyecto dentro de un tiempo definido, asegurando el estudio sistemático de todas proteínas codificadas en cada uno de los 23 cromosomas y sus implicaciones patológicas.

 

Referencias bibliográficas 

 

Journal Proteome Research, 2015 Volume 14, Issue 9

“Integration of Proteomics and Transcriptomics Data Sets for the Analysis of a Lymphoma B-Cell Line in the Context of the Chromosome-Centric Human Proteome Project”

Paula Díez, Conrad Droste, Rosa M. Dégano, María González-Muñoz, Nieves Ibarrola, Martín Pérez-Andrés, Alba Garin-Muga, Víctor Segura, Gyorgy Marko-Varga, Joshua LaBaer, Alberto Orfao, Fernando J. Corrales, Javier De Las Rivas, and Manuel Fuentes

pp 3530–3540

Publication Date (Web): July 28, 2015 (Article)

DOI: 10.1021/acs.jproteome.5b00474

 

 

 

Journal Proteome Research, 2015 Volume 14, Issue 9

“Quest for Missing Proteins: Update 2015 on Chromosome-Centric Human Proteome Project”

Péter Horvatovich, Emma K. Lundberg, Yu-Ju Chen, Ting-Yi Sung, Fuchu He, Edouard C. Nice, Robert J. Goode, Simon Yu, Shoba Ranganathan, Mark S. Baker, Gilberto B. Domont, Erika Velasquez, Dong Li, Siqi Liu, Quanhui Wang, Qing-Yu He, Rajasree Menon, Yuanfang Guan, Fernando J. Corrales, Victor Segura, J. Ignacio Casal, Alberto Pascual-Montano, Juan P. Albar, Manuel Fuentes, Maria Gonzalez-Gonzalez, Paula Diez, Nieves Ibarrola, Rosa M. Degano, Yassene Mohammed, Christoph H. Borchers, Andrea Urbani, Alessio Soggiu, Tadashi Yamamoto, Ghasem Hosseini Salekdeh, Alexander Archakov, Elena Ponomarenko, Andrey Lisitsa, Cheryl F. Lichti, Ekaterina Mostovenko, Roger A. Kroes, Melinda Rezeli, Ákos Végvári, Thomas E. Fehniger, Rainer Bischoff, Juan Antonio Vizcaíno, Eric W. Deutsch, Lydie Lane, Carol L. Nilsson, György Marko-Varga, Gilbert S. Omenn, Seul-Ki Jeong, Jong-Sun Lim, Young-Ki Paik, and William S. Hancock

pp 3415–3431

Publication Date (Web): June 15, 2015 (Perspective)

DOI: 10.1021/pr5013009

 

 

Journal Proteome Research, 2015 Volume 14, Issue 9
In Vitro Transcription/Translation System: A Versatile Tool in the Search for Missing Proteins

Péter Horvatovich, Ákos Végvári, Justin Saul, Jin G. Park, Ji Qiu, Michael Syring, Patrick Pirrotte, Konstantinos Petritis, Tony J. Tegeler, Meraj Aziz, Manuel Fuentes, Paula Diez, Maria Gonzalez-Gonzalez, Nieves Ibarrola, Conrad Droste, Javier De Las Rivas, Concha Gil, Felipe Clemente, Maria Luisa Hernaez, Fernando J. Corrales, Carol L. Nilsson, Frode S. Berven, Rainer Bischoff, Thomas E. Fehniger, Joshua LaBaer, and György Marko-Varga

pp 3441–3451

Publication Date (Web): July 9, 2015 (Perspective)

DOI: 10.1021/acs.jproteome.5b00486