Centro do Câncer desenvolve ferramenta informática que analisa as funções dos genes

JPA/DICYT O Centro de Investigação do Câncer (CIC) de Salamanca desenvolveu uma ferramenta informática que permite comprovar quais funções têm um conjunto de genes. Esta aplicação informática já está disponível na Internet e facilita o trabalho dos pesquisadores, dos que se dedicam a Biologia básica aos que estudam os tumores. Celia Fontanillo, pesquisadora do Grupo de Bioinformática, desenvolveu a ferramenta e a apresentou no dia 01 de dezembro em uma conferência.

“Me dedico sobretudo à Genômica funcional, ou seja, procuro identificar as funções mais importantes dos genes desregulados em um processo determinado”, declarou a DiCYT a cientista de Zamora. “Não estamos pesquisando nenhum tipo de doença, mas criando aplicações informática para que outras pessoas possam usá-las em seus estudos”, esclarece.

Por exemplo, “em uma pesquisa sobre câncer, poder-se-ia ver quais genes estão desregulados e assim verificar quais são as funções presentes nestes genes”. O objetivo da nova aplicação informática é fazer com que esta informação possa ser obtida de forma automática, para que seja fácil de ler e se possa identificar com simplicidade os processos mais importantes. Para comprovar sua efetividade, “aplicamos esta ferramenta em diferentes tipos de dados já publicados sobre vários tipos de câncer”, afirma.

Ainda que já existam ferramentas que estudam as funções dos genes, o universo abarcado pelas pesquisas é muito grande. “Deve-se buscar as possíveis combinações de funções associadas aos genes estudados e para tanto é necessário ter prontas funções muito grandes. Para uma pessoa que estuda uma doença é muito complicado, porque há uma lista de genes e de funções e não é possível extrair conhecimento de toda essa quantidade de informação”, comenta a pesquisadora.

No entanto, a ferramenta desenvolvida por Celia Fontanillo realiza uma filtragem e apresenta a informação de uma maneira que faz com que os cientistas vejam claramente os principais processos. Definitivamente, “é uma ferramenta de ajuda e não existe nenhuma até agora que realize a filtragem e o agrupamento em módulos funcionais desta maneira”, afirma.

A aplicação poderia ser utilizada por especialistas dedicados a pesquisar uma determinada doença, como um tipo de câncer, mas também serve para estudar a Biologia molecular de uma forma muito mais básica e comprovar, por exemplo, “quais genes se expressam mais nas células do cérebro com relação ao pulmão”.