Especialistas procuram na informática o apoio para processar a grande quantidade de dados da proteômica

JPA/DICYT O avanço da tecnologia gerou uma grande quantidade de dados no campo da proteômica, a ciência que estuda e caracteriza as proteínas que se expressam no genoma. Para analisar o conjunto destas proteínas, denominado proteoma, faz-se necessário o apoio da bioinformática, a única maneira de poder processar o volume de informação que proporcionam os laboratórios. Por isso, especialistas nacionais e internacionais reuniram-se hoje no Centro de Pesquisa do Câncer de Salamanca para abordar esta questão, chave no avanço da Biomedicina de um ponto de vista multidisciplinar. Trata-se da última reunião da primeira fase do Instituto Nacional de Proteômica (Proteored), que iniciará uma nova etapa com financiamento diferente a partir deste ano.

Até poucos anos atrás, no momento de realizar estudos proteômicos existia uma “barreira técnica” que foi superada na última década com um “desenvolvimento espetacular” da tecnologia que permitiu caracterizar as proteínas em distintos contextos. No entanto, fica uma matéria pendente, “digerir toda esta informação”, assegura Xosé Bustelo, pesquisador do Centro do Câncer, em declarações colhidas por DiCYT.

O objetivo é extrair dados que permitam agrupar as proteínas ou conhecer suas funções. Neste contexto, o encontro que se celebra no Centro do Câncer trata de abordar quais são as novas ferramentas que estão à disposição dos cientistas para compreender as mudanças proteômicas, de maneira que “esta informação seja útil a toda a comunidade científica”. O propósito dos especialistas é estandarizar os protocolos, de maneira que os pesquisadores disponham de pelo menos uma informação mínima para interpretar os bancos de dados nos que se armazena toda a produção científica relacionada com a proteômica. Assim, se avançará em um “conhecimento melhor de nossas células e como modificam-se em condições patológicas”, indica Bustelo.

Para tal, ProteoRed oferece um serviço para os cientistas ao mesmo tempo que contribui com a resolução de problemas bioinformáticos. Trata-se de uma “iniciativa exemplar na Europa”, assegura Bustelo, já que coloca à disposição da comunidade científica técnicas difíceis e de difícil acesso.

Produção massiva de dados

Juan Pablo Albar, coordenador de ProteoRed, assegurou que neste âmbito o problema é a produção massiva de dados. “A informação é complexa e temos que evitar que se propague o que chamamos lixo informacional, de maneira que os dados sejam o mais depurados possível”, indica. Neste sentido, a grande capacidade para transmitir dados que possibilitam as novas tecnologias faz com que seja especialmente grave a publicação de um dado errôneo acerca das funções de certas proteínas, segundo explica. Assim, a informação repercute na qualidade das pesquisas de maneira que com os dados que proporciona a bioinformática “podemos focalizar os alvos aos quais direcionar nossos esforços”, isto é, que os cientistas possam conhecer, por exemplo, que moléculas são as mais importantes em uma determinada patologia para centrar nelas a pesquisa sobre possíveis tratamentos.

Em definitiva, a associação entre a Informática e a proteômica trata de “extrair a informação útil que produza cada laboratório” de maneira que chegue a toda a comunidade científica. Para isso, todos os dados devem ser de qualidade, estandarizados e interpretáveis. Em alguns casos, os pesquisadores nem sequer terão que fazer novos experimentos, mas “baixar a informação útil e usá-la”.

A forma de alcançar este objetivo passa pela união da proteômica e da informática, de maneira que são necessários tanto especialistas em proteômica que se formem em Informática como informáticos que se formem em proteômica, asseguram. Neste sentido, é necessário contar com “profissionais novos que não existem”, afirmam, e por isso seria conveniente contar com novos programas de mestrado direcionados a este âmbito.

Futuro financiamento de ProteoRed

Neste sentido, o papel de ProteoRed foi chave para o desenvolvimento da proteômica espanhola, asseguram especialistas. Há uma década, os únicos serviços que ofereciam os laboratórios espanhóis era a identificação de proteínas, enquanto que agora os que estão integrados em ProteoRed podem comparar proteomas, estando ao longo destes últimos anos “próximos à fronteira do conhecimento”, além de que foram incorporando as mais modernas tecnologias para oferecer-las à comunidade científica.

De todos modos, ProteoRed teve que superar um importante problema de financiamento, já que este ano finaliza-se a primeira fase do projeto, financiada pela Fundação Genoma Espanha. A partir de agora, será o Instituto de Saúde Carlos III o que se encarregará de financiar-lo, assim como ocorre com outros projetos que dependiam da Fundação Genoma Espanha, como é o caso do Banco Nacional de DNA, cuja sede está no Centro de Pesquisa do Câncer de Salamanca.

A contribuição de Salamanca

ProteoRed está organizada em seis nós que se direcionam desde Madri, Bilbao, Barcelona, Salamanca, Valência e Córdoba. No caso de Salamanca, o responsável pelo projeto é Xosé Bustelo, cientista do Centro de Pesquisa do Câncer (CIC, sigla em espanhol). A partir deste centro se cobre a demanda da parte de Castela e Leão e da Galícia, que tem sua própria sede associada a Salamanca.